（1）常平大京九物流基地
2002年，常平镇成立大京九物流园开发有限公司，按照企业运作的模式统筹物流园的开发建设。物流园区控制性规划用地4500亩，已建成项目有东莞市粮油饲料批发市场、东莞市大京九农副产品中心批发市场、常平会展中心、黄埔海关快件监管中心和大京九塑胶原料市场等。其中快件监管中心占地70多亩，总投资约7000万元，目前进入中心处理快件的客户已达500多家，包括联邦、DHL、UPS等国际知名快递公司。大京九物流基地的项目基本以批发市场为主，依托比较成熟的铁路货运优势，以农副产品批发流通带动当地货运仓储行业的发展。但除快件监管中心外，基地内没有其他专业的物流配套设施，第三方物流企业也很少。
（2）虎门港物流基地
虎门港已建有大小码头123座，泊位207个，码头泊位总长1.3万米。最大靠泊能力为集装箱及多用码头5千吨级，油码头2万吨级，煤码头5万吨级。目前虎门港已完成《东莞市虎门港物流体系发展策略规划》，在建项目有港口大道、沙田港区5＃6＃集装箱泊位、立沙岛中油通达石油库等8个石化仓储码头项目、省直属粮库等。招商引资取得可喜成果，但由于港口基础较差，作为国家一类口岸，目前虎门港只能处理5万吨级以下货船，仅少量码头建有仓库，仓储面积少，缺乏处理远洋货船的条件，除沙田建有海关联检大楼外，基本无其他现代物流配套设施，港区与全市大部分镇区的交通联系仍相当不方便，严重制约了虎门港的发展。
（3）松山湖物流基地
原规划用地1.5平方公里，市保税物流中心转移给虎门港立项建设后，松山湖物流基地已经市委常委、副市长联系会议讨论取消立项建设，只预留100亩地用作发展物流配套设施和项目。
松山湖物流基地项目的取消，使得东莞除服务铁路、港口之外的，服务内陆公路物流基地的建设一支未能跟上发展需要，落后于铁路、港口配套物流基地、园区的建设和发展。
从物流基地、园区的建设情况而言，东莞现阶段物流基地、园区的建设为东莞物流业的发展打下了基础，但其发展未能满足东莞现代物流业快速发展的要求，基于铁路、码头的基地建设相对先行，基于公路物流运输基地建设和配套建设则较为滞后，在松山湖物流基地立项取消后，东莞公路物流大型园区、基地的建设未能有进一步的明确规划，而公路物流基地和配套园区建设滞后，直接影响了整个东莞物流体系的完善和顺畅运行。
